二级建造师证书不注册不会作废，但是二级建造师不注册是不能以二级建造师名义执业的。一级建造师证书注册有效期为3年，根据《注册建造师管理规定》，取得建造师执业资格证书的人员，必须经过注册登记，方可以建造师名义执业，此规定还提到了二级建造师初始注册所需要的条件。
二级建造师初始注册条件1. 经考核认定或考试合格取得资格证书；
2. 受聘于一个相关单位；
3. 达到继续教育要求。
所需资料：
注册建造师初始注册申请表；
资格证书、学历证书和身份证明复印件；
申请人与聘用单位签订的聘用劳动合同复印件或其他有效证明文件；
逾期申请初始注册的，应但提供达到继续教育要求的证明材料。
二级建造师注册流程1、上“二级建造师注册管理系统”个人版，点“注册”并输入信息，记住密码；
2、通过密码登陆系统，在出现的版块里填个人真实资料；最好填写两个自己参与过的工程信息；
3、提交；
4、插入你准备注册的企业密码锁登陆“二级建造师注册管理系统”企业版，点击同意并上报；
5、打印带条形码的表格并盖章签字，上交主管部门。
6、用档案袋装如下纸质材料上交到主管部门：申请表、企业资质复印件、执业资格证书复印件、毕业证书复印件、身份证复印件、合同复印件、照片
以上完善并完成注册，注册审查时间到发证一般为半年。证件时间过期之后的二级建造师注册流程不需要按照以上流程，只需要再进行核对并考试合格就可以。
